Wenn die kariesbedingte Infektion in den Wurzelkanal des Zahns eindringt, breitet sie sich zur Zahnspitze hin aus. Von dort aus dringt sie in den umgebenden Knochen ein, wo sich im Laufe der Zeit ein infektiöser Prozess bildet. Bei der Wurzelspitzenresektion wird der infektiöse Prozess aus dem Bereich der Zahnwurzelspitze zusammen mit der Wurzelspitze entfernt.
Ziel der Wurzelspitzenresektion ist es, die verbleibende Infektion im Bereich der Wurzelspitze zu entfernen, wenn dies durch eine endodontische Behandlung des Wurzelkanals nicht möglich ist.